En el CERNAR, además de estudios de base y aplicados al manejo y uso sustentable de la flora, también se realizan estudios a nivel de la fauna silvestre. Entre estos últimos se destacan los proyectos de investigación con el fin de evaluar el efecto de los cambios en el uso del suelo sobre la distribución y abundancia de grupos funcionales de vertebrados que proveen servicios ecosistémicos en ambientes chaqueños de Córdoba. Asimismo, se avanza con estudios relacionados a la percepción sobre estos grupos funcionales por parte de los pobladores rurales. Otros trabajos se enfocan en el rol de las aves para la restauración del Espinal al sur de la provincia.
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